ภาระโรคที่สูงที่สุดพบได้ในภูมิภาคใต้ทะเลทรายซาฮาราของแอฟริกา หรือที่เรียกว่า African Meningitis Belt ซึ่งเป็นที่รู้จักโดยเฉพาะอย่างยิ่งว่ามีความเสี่ยงสูงต่อโรคไข้กาฬหลังแอ่น แต่ยังรวมถึงโรคเยื่อหุ้ม สมอง อักเสบจากนิวโมคอคคัสด้วย ประเทศไนเจอร์มีพื้นที่ส่วนใหญ่อยู่ในแถบเยื่อหุ้มสมองอักเสบของแอฟริกา ซึ่งการแพร่ระบาดของโรคเยื่อหุ้มสมองอักเสบมักเป็นไปตามรูปแบบตามฤดูกาล (โดยปกติคือตั้งแต่เดือนมกราคมถึงมิถุนายน) โดยมีขนาดแตกต่างกันไปในแต่ละปี ในปี 2558 เกิดการระบาดของเยื่อหุ้มสมองอักเสบขนาดใหญ่จาก NmC ซึ่งส่งผลกระทบต่อผู้คน